女性生殖器官本身的器质性病变或内分泌功能障碍而造成不孕，有以下几点：
1.子宫异常：
1)先天性发育异常：先天性无子宫，各种子宫畸形，如单角子宫、双角子宫、舟状子宫、双子宫、子宫横隔或纵隔、幼稚型子宫等均可造成不孕。
2)子官萎缩：如哺乳、年老、子宫内股过度摄利、结核、贫血 、代谢性疾病、卵巢功能衰退等均可导致子宫萎缩引起不孕。
3)其他：子宫肌瘤、子宫内膜异位症、子宫内膜息肉、子宫体腺癌、子宫内膜炎、子宫内膜粘连、子宫内膜功能异常、子宫位置异常、子宫脱垂 等均不利于受孕。
2.内分泌异常：下丘脑、垂体、卵巢之间内分泌平衡失调时，均可影响卵巢功能，出现月经不调、无月经、月经 稀发等而造成不孕。
3.全身性疾病：
1)急性传染病：如腮腺炎 、猩红热、霍乱、先天性梅毒 、结核等疾病均能损害卵巢或影响其功能而致不孕。
2)化学物理性因素：如铅、汞的中毒，吸烟，饮酒，放射性因素，环境的改变，维生素类的缺乏等，对受孕亦有影响。
4.精神神经异常：精神过度紧张，严重时成为精神性的“求子狂”等可造成内分泌紊乱而不孕。
5.盆腔、腹膜异常：盆腔炎 、盆腔腹膜炎 、结核性腹膜炎 、腹膜子宫内股异位症等均可造成不孕。
6.输卵管异常：女性不孕症中有20%～40%系因输卵管不通而不能受孕。常见原因有输卵管炎症、输卵管形态异常、输卵管痉挛、输卵管结核、输卵管积液等。
7.外阴 异常：加半阴阳人、外阴 萎缩粘连、外阴 肿瘤、外阴 溃疡、外阴 外伤等均可影响妊娠。
8.阴道异常：
1)阴道炎 症：滴虫、霉菌、细菌等感染破坏阴道自然防御机能，改变正常的酸性环境，引起阴道炎症，均可降低精子的活动能力和缩短精子的生存时间，造成暂时性不孕。
2)发有异常：处女膜闭锁、狭窄、僵硬，先天性无阴道，阴道纵隔、横隔，阴道狭窄或上段闭锁等均可造成不孕。
9.原因不明的不孕：经过不孕原因的系统检查，双方均未发现明确的不孕原因者，有10%左右。
此外，免疫因素亦可引起不孕。男子的精子进入女性阴道，作为一种异体蛋白--抗原，使女子体内产生抗体，有些妇女的这种免疫反应特别强烈，使精子凝聚而失去活动力，导致不孕。
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